Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXO1Q12778 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms