Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YPP1YGR198W 2454 nt2.34□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 ARP8YOR141C 2646 nt2.34□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 UBP15YMR304W 3693 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 NUP100YKL068W 2880 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 snR62snR62 100 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 ESC1YMR219W 4977 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 COG4YPR105C 2586 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 VPS8YAL002W 3825 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 TCB2YNL087W 3537 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 SLI15YBR156C 2097 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 NUM1YDR150W 8247 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 PDR1YGL013C 3207 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 BFR2YDR299W 1605 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 AGC1YPR021C 2709 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 MET18YIL128W 3099 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 RIF1YBR275C 5751 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 RSE1YML049C 4086 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 MDS3YGL197W 4464 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 SAP185YJL098W 3177 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 RPL37BYDR500C 267 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 YOR055WYOR055W 435 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1A-NL1Q12391 DBP10YDL031W 2988 nt2.28□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YDL206WYDL206W 2289 nt2.28□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 IST2YBR086C 2841 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 SPF1YEL031W 3648 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 UFD2YDL190C 2886 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 ADR1YDR216W 3972 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 SCP160YJL080C 3669 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 SVL3YPL032C 2478 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 CHC1YGL206C 4962 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 TAH1YCR060W 336 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 CTR9YOL145C 3234 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 TRA1YHR099W 11235 nt2.24□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 TRS130YMR218C 3309 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 GEA1YJR031C 4227 nt2.23□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 IRE1YHR079C 3348 nt2.22□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 PSD2YGR170W 3417 nt2.21□□□□□ -2.05
TY1A-NL1Q12391 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YER138CYER138C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YER160CYER160C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YJR027WYJR027W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YML039WYML039W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YML045WYML045W 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YMR050CYMR050C 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 TRL1YJL087C 2484 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.21□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 PET309YLR067C 2898 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 CDC60YPL160W 3273 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 EAF1YDR359C 2949 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 GIP3YPL137C 3831 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YEF3YLR249W 3135 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 VPS13YLL040C 9435 nt2.2□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 RSM22YKL155C 1887 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 SYH1YPL105C 2550 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 FRK1YPL141C 2598 nt2.19□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 PDR8YLR266C 2106 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 TBS1YBR150C 3285 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 COX5BYIL111W 456 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YNL266WYNL266W 420 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 SGM1YJR134C 2124 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 COG6YNL041C 2520 nt2.18□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 BIR1YJR089W 2865 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 SLX4YLR135W 2247 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 KAP120YPL125W 3099 nt2.17□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 RPS29AYLR388W 171 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 RAV1YJR033C 4074 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1A-NL1Q12391 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 FKS3YMR306W 5358 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 POL5YEL055C 3069 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 FAR11YNL127W 2862 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 SGS1YMR190C 4344 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 YDR210WYDR210W 228 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1A-NL1Q12391 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.14□□□□□ -2.07
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