Protein–RNA interactions for Protein: Q12386

ARP8, Actin-like protein ARP8, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP8Q12386 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.55□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.55□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 YNL266WYNL266W 420 nt3.55□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 CAF120YNL278W 3183 nt3.55□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt3.54□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 TBS1YBR150C 3285 nt3.54□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 SGM1YJR134C 2124 nt3.53□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 DRS2YAL026C 4068 nt3.53□□□□□ -1.84
ARP8Q12386 AGC1YPR021C 2709 nt3.52□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt3.52□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 SPO71YDR104C 3738 nt3.52□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt3.51□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 ADR1YDR216W 3972 nt3.51□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 TRS130YMR218C 3309 nt3.51□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 SEC1YDR164C 2175 nt3.51□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 RTP1YMR185W 2946 nt3.5□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YDR210WYDR210W 228 nt3.5□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 COX5BYIL111W 456 nt3.5□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt3.49□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YOR296WYOR296W 3870 nt3.49□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.48□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 NMD2YHR077C 3270 nt3.48□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 YLR278CYLR278C 4026 nt3.47□□□□□ -1.85
ARP8Q12386 FRK1YPL141C 2598 nt3.45□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 snR53snR53 91 nt3.45□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RGC1YPR115W 3252 nt3.45□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 GEA1YJR031C 4227 nt3.45□□□□□ -1.86 RIP-Chip
ARP8Q12386 REV3YPL167C 4515 nt3.45□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 CSR2YPR030W 3366 nt3.44□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RPM2YML091C 3609 nt3.44□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 GCN1YGL195W 8019 nt3.44□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 SEC26YDR238C 2922 nt3.43□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 TDA9YML081W 3756 nt3.43□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RTT107YHR154W 3213 nt3.43□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 CTR9YOL145C 3234 nt3.43□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RAD9YDR217C 3930 nt3.42□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 SSD1YDR293C 3753 nt3.42□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RAX2YLR084C 3663 nt3.42□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 snR70snR70 164 nt3.41□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.41□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 RSM22YKL155C 1887 nt3.41□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 NUP100YKL068W 2880 nt3.41□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 MSB2YGR014W 3921 nt3.4□□□□□ -1.86
ARP8Q12386 UBR1YGR184C 5853 nt3.39□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt3.38□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 SGS1YMR190C 4344 nt3.38□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 DNA2YHR164C 4569 nt3.37□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 SPO14YKR031C 5052 nt3.37□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 PDR3YBL005W 2931 nt3.37□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 GCN2YDR283C 4980 nt3.36□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 POL2YNL262W 6669 nt3.36□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 YSP2YDR326C 4317 nt3.35□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 RPN1YHR027C 2982 nt3.35□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 YER172C-AYER172C-A 381 nt3.35□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 RPS26AYGL189C 360 nt3.35□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 TRL1YJL087C 2484 nt3.34□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt3.34□□□□□ -1.87
ARP8Q12386 YLR041WYLR041W 321 nt3.33□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt3.33□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 SYH1YPL105C 2550 nt3.32□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 ALY2YJL084C 3141 nt3.32□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 COA6YMR244C-A 315 nt3.32□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 YML002WYML002W 2214 nt3.32□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 SEY1YOR165W 2331 nt3.32□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 NUT1YGL151W 3399 nt3.31□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 PAN2YGL094C 3348 nt3.31□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt3.31□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 ILS1YBL076C 3219 nt3.3□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 YLR232WYLR232W 348 nt3.29□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 DYN1YKR054C 12279 nt3.28□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 RPS29AYLR388W 171 nt3.28□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 YIL169CYIL169C 2988 nt3.28□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 GLG1YKR058W 1851 nt3.28□□□□□ -1.88
ARP8Q12386 PMR1YGL167C 2853 nt3.27□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 FAR11YNL127W 2862 nt3.27□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 NUP157YER105C 4176 nt3.26□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 ESL1YIL151C 3357 nt3.26□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 PRP8YHR165C 7242 nt3.26□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 MYO2YOR326W 4725 nt3.26□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.26□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YER138CYER138C 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YER160CYER160C 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YJR027WYJR027W 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YML039WYML039W 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YML045WYML045W 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YMR050CYMR050C 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 RGA1YOR127W 3024 nt3.25□□□□□ -1.89
ARP8Q12386 IRE1YHR079C 3348 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms