Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.1□□□□□ -2.23
TIR4Q12218 YIR044CYIR044C 186 nt1.1□□□□□ -2.23
TIR4Q12218 YPR063CYPR063C 423 nt1.1□□□□□ -2.23
TIR4Q12218 VPS55YJR044C 423 nt1.09□□□□□ -2.23
TIR4Q12218 CUL3YGR003W 2235 nt1.09□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 EST2YLR318W 2655 nt1.09□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 COG4YPR105C 2586 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 NUT1YGL151W 3399 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 SPT21YMR179W 2277 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YIL032CYIL032C 357 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 RPL34BYIL052C 366 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YCK3YER123W 1575 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 AIM44YPL158C 2277 nt1.08□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 LCD1YDR499W 2244 nt1.07□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 PKH2YOL100W 3246 nt1.07□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 MPT5YGL178W 2580 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 KAP122YGL016W 3246 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 snR60snR60 104 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 snR65snR65 100 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 SSS1YDR086C 243 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YHL042WYHL042W 453 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.06□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 PTP2YOR208W 2253 nt1.05□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 ALG13YGL047W 609 nt1.05□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 snR14snR14 160 nt1.05□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 RAD9YDR217C 3930 nt1.05□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YLL007CYLL007C 1998 nt1.05□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 RSM22YKL155C 1887 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 HMRA2YCR096C 360 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 GPG1YGL121C 381 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.04□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 MMS4YBR098W 2076 nt1.03□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 NUP188YML103C 4968 nt1.03□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 YDR344CYDR344C 444 nt1.03□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 RRT15YLR162W-A 189 nt1.03□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 PIP2YOR363C 2991 nt1.03□□□□□ -2.24
TIR4Q12218 FIG4YNL325C 2640 nt1.02□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 IFH1YLR223C 3258 nt1.02□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 VIK1YPL253C 1944 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 COG8YML071C 1824 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YER181CYER181C 324 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YDL206WYDL206W 2289 nt1.01□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 ALY2YJL084C 3141 nt1□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YLL020CYLL020C 306 nt1□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 NUP192YJL039C 5052 nt1□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 NST1YNL091W 3723 nt1□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SWI4YER111C 3282 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YDR521WYDR521W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 INA22YIR024C 651 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 RPS25BYLR333C 327 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YMR321CYMR321C 318 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 RAD61YDR014W 1944 nt0.99□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SPO75YLL005C 2607 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YGR069WYGR069W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 RPS27BYHR021C 249 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YNL028WYNL028W 318 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 CSE2YNR010W 450 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YOR218CYOR218C 420 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SLD3YGL113W 2007 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 STO1YMR125W 2586 nt0.98□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 BEM2YER155C 6504 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 PDE2YOR360C 1581 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SPO21YOL091W 1830 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YJL120WYJL120W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SET3YKR029C 2256 nt0.97□□□□□ -2.25
TIR4Q12218 SMC1YFL008W 3678 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 MDS3YGL197W 4464 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YCS4YLR272C 3531 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 LAA1YJL207C 6045 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YBR206WYBR206W 324 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 APL3YBL037W 3078 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 NUP145YGL092W 3954 nt0.96□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 TRM732YMR259C 4263 nt0.95□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YAR009CYAR009C 3591 nt0.95□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 MSN5YDR335W 3675 nt0.95□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 PAN2YGL094C 3348 nt0.95□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.94□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 APL1YJR005W 2103 nt0.94□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 SPT7YBR081C 3999 nt0.93□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 IES4YOR189W 351 nt0.93□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 WAR1YML076C 2835 nt0.93□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 SEC3YER008C 4011 nt0.93□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 MSH3YCR092C 3057 nt0.92□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 ECM12YHR021W-A 456 nt0.92□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 SIP4YJL089W 2490 nt0.91□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TIR4Q12218 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.1 ms