Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 SPO21YOL091W 1830 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 PFD1YJL179W 330 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 GCN2YDR283C 4980 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 COG4YPR105C 2586 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 RAD50YNL250W 3939 nt1.85□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 EMC5YIL027C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YJL120WYJL120W 324 nt1.84□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.84□□□□□ -2.11
HFI1Q12060 PKH2YOL100W 3246 nt1.83□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 MCM10YIL150C 1716 nt1.83□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 NPR2YEL062W 1848 nt1.83□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 VPS55YJR044C 423 nt1.83□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 SBE22YHR103W 2559 nt1.83□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.82□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.82□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 PBY1YBR094W 2262 nt1.82□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 SKI3YPR189W 4299 nt1.81□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 ALK1YGL021W 2283 nt1.81□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 CHS1YNL192W 3396 nt1.81□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 RTP1YMR185W 2946 nt1.8□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 RRT15YLR162W-A 189 nt1.8□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 UFD2YDL190C 2886 nt1.8□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 YGL217CYGL217C 342 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 COA6YMR244C-A 315 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 YBR174CYBR174C 315 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 LRE1YCL051W 1752 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 CTF4YPR135W 2784 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 SMC4YLR086W 4257 nt1.79□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 CAT8YMR280C 4302 nt1.78□□□□□ -2.12
HFI1Q12060 MON2YNL297C 4911 nt1.78□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 NUT1YGL151W 3399 nt1.77□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 snR74snR74 88 nt1.77□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YDR521WYDR521W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YOR376WYOR376W 369 nt1.77□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 MSH3YCR092C 3057 nt1.77□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 TBS1YBR150C 3285 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 BRR2YER172C 6492 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 APQ12YIL040W 417 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 COF1YLL050C 432 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 SGF11YPL047W 300 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YLL054CYLL054C 2532 nt1.76□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 SLX4YLR135W 2247 nt1.75□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 IFH1YLR223C 3258 nt1.75□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YOR302WYOR302W 78 nt1.75□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 PKH3YDR466W 2697 nt1.75□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 AIM44YPL158C 2277 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 ADR1YDR216W 3972 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YJL022WYJL022W 309 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YNL337WYNL337W 255 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 PIP2YOR363C 2991 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YKU70YMR284W 1809 nt1.74□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YLR419WYLR419W 4308 nt1.73□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YHR210CYHR210C 1026 nt1.73□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.73□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YLR140WYLR140W 327 nt1.72□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 CDC31YOR257W 486 nt1.72□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 YBR206WYBR206W 324 nt1.72□□□□□ -2.13
HFI1Q12060 NCA2YPR155C 1851 nt1.71□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.71□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YDL206WYDL206W 2289 nt1.71□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 MMS4YBR098W 2076 nt1.71□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YLR422WYLR422W 5799 nt1.7□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 VPS15YBR097W 4365 nt1.7□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 OLI1Q0130 231 nt1.7□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 KCS1YDR017C 3153 nt1.7□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 PMD1YER132C 5262 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 AHC1YOR023C 1701 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 ISD11YER048W-A 285 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 ECM12YHR021W-A 456 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 SLD3YGL113W 2007 nt1.69□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 PAM16YJL104W 450 nt1.68□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.68□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 snR14snR14 160 nt1.68□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 ALY2YJL084C 3141 nt1.68□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YOR019WYOR019W 2193 nt1.68□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YEL014CYEL014C 306 nt1.67□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 BST1YFL025C 3090 nt1.67□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 SAC3YDR159W 3906 nt1.67□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 FIG4YNL325C 2640 nt1.66□□□□□ -2.14
HFI1Q12060 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.65□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 ULI1YFR026C 510 nt1.65□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 IRA1YBR140C 9279 nt1.64□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 KAP122YGL016W 3246 nt1.64□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 SMC1YFL008W 3678 nt1.63□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 YDL196WYDL196W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.62□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 PAN2YGL094C 3348 nt1.62□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 SSK2YNR031C 4740 nt1.6□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 LAA1YJL207C 6045 nt1.6□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 YAR009CYAR009C 3591 nt1.6□□□□□ -2.15
HFI1Q12060 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.6□□□□□ -2.15
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