Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC173Q0VFZ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms