Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGEF1BQ0VAM2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms