Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RIPPLY1Q0D2K3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms