Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4F3Q08477 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms