Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

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Length 1,176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 snR61snR61 90 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 OST4YDL232W 111 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SBH1YER087C-B 249 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SCP160YJL080C 3669 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SAP190YKR028W 3102 nt2.32□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SSD1YDR293C 3753 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YNL211CYNL211C 261 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YJR039WYJR039W 3366 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 TDA9YML081W 3756 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YER138CYER138C 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YER160CYER160C 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YJR027WYJR027W 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YML039WYML039W 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YML045WYML045W 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YMR050CYMR050C 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 FKS3YMR306W 5358 nt2.31□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 AGC1YPR021C 2709 nt2.3□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 TTI1YKL033W 3117 nt2.3□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YLR282CYLR282C 342 nt2.3□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 TRL1YJL087C 2484 nt2.29□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.29□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.29□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SYH1YPL105C 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 SLN1YIL147C 3663 nt2.28□□□□□ -2.04
AVO1Q08236 PDR3YBL005W 2931 nt2.28□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 COG4YPR105C 2586 nt2.27□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 IRC8YJL051W 2469 nt2.27□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 CTR9YOL145C 3234 nt2.27□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 BUD2YKL092C 3315 nt2.26□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 UBP1YDL122W 2430 nt2.26□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 TRM3YDL112W 4311 nt2.26□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 ARP8YOR141C 2646 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 PKH2YOL100W 3246 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 PRP5YBR237W 2550 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 IST2YBR086C 2841 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 snR70snR70 164 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 RPL37BYDR500C 267 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 SLI15YBR156C 2097 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 POL5YEL055C 3069 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YOR019WYOR019W 2193 nt2.25□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.24□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 CMC4YMR194C-B 222 nt2.24□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 APL1YJR005W 2103 nt2.24□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 MDS3YGL197W 4464 nt2.23□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YDL118WYDL118W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 GIP3YPL137C 3831 nt2.23□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 USO1YDL058W 5373 nt2.23□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YNL144CYNL144C 2223 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 CHC1YGL206C 4962 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YLL054CYLL054C 2532 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 HIR3YJR140C 4947 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 CDC60YPL160W 3273 nt2.22□□□□□ -2.05
AVO1Q08236 SIR4YDR227W 4077 nt2.2□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 CHS6YJL099W 2241 nt2.2□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.2□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 PDR11YIL013C 4236 nt2.19□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 YGL182CYGL182C 324 nt2.19□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.19□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 YDL206WYDL206W 2289 nt2.19□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 STB6YKL072W 2301 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 LHS1YKL073W 2646 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 SOM1YEL059C-A 225 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 YPP1YGR198W 2454 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 TOR2YKL203C 7425 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 FRK1YPL141C 2598 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 NUT1YGL151W 3399 nt2.18□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 ADR1YDR216W 3972 nt2.17□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 MSB1YOR188W 3414 nt2.17□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 VPS13YLL040C 9435 nt2.17□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 STE11YLR362W 2154 nt2.17□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 UFD2YDL190C 2886 nt2.16□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 STF2YGR008C 255 nt2.16□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 IRA2YOL081W 9240 nt2.15□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 SCD5YOR329C 2619 nt2.15□□□□□ -2.06
AVO1Q08236 MGA2YIR033W 3342 nt2.15□□□□□ -2.07
AVO1Q08236 RTT101YJL047C 2529 nt2.15□□□□□ -2.07
AVO1Q08236 TMA7YLR262C-A 195 nt2.15□□□□□ -2.07
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