Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms