Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 HTB2YBL002W 396 nt-0.84□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.84□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.84□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.84□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 RSM23YGL129C 1353 nt-0.86□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 IRC2YDR112W 309 nt-0.88□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 YJL135WYJL135W 318 nt-0.88□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 COX7YMR256C 183 nt-0.89□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.89□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 YOR345CYOR345C 351 nt-0.89□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 snR161snR161 161 nt-0.89□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 snR59snR59 78 nt-0.9□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 ATC1YDR184C 885 nt-0.9□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 YAP6YDR259C 1152 nt-0.9□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 YOL106WYOL106W 354 nt-0.9□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 SNU56YDR240C 1479 nt-0.9□□□□□ -2.55
GDB1Q06625 BLS1YLR408C 369 nt-0.91□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.93□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YLR198CYLR198C 360 nt-0.93□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 snR36snR36 182 nt-0.93□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YPL205CYPL205C 345 nt-0.94□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.94□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YOR366WYOR366W 354 nt-0.94□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 SPO21YOL091W 1830 nt-0.95□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YOL160WYOL160W 342 nt-0.95□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 snR33snR33 183 nt-0.95□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YDR269CYDR269C 324 nt-0.96□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 RMD6YEL072W 696 nt-0.96□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 PBI2YNL015W 228 nt-0.96□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 UBS1YBR165W 834 nt-0.96□□□□□ -2.56
GDB1Q06625 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.98□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 PSF2YJL072C 642 nt-0.98□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 GPX1YKL026C 504 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 IRC13YOR235W 315 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YOR248WYOR248W 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YKL111CYKL111C 336 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YOR364WYOR364W 369 nt-0.99□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-1□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-1□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YIR044CYIR044C 186 nt-1.01□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 LIN1YHR156C 1023 nt-1.02□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-1.03□□□□□ -2.57
GDB1Q06625 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-1.04□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YPL261CYPL261C 309 nt-1.05□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 LRP1YHR081W 555 nt-1.05□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-1.05□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 DIE2YGR227W 1578 nt-1.06□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-1.07□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 ACF4YJR083C 930 nt-1.07□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.08□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YPR096CYPR096C 303 nt-1.08□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YER188C-AYER188C-A 300 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YGR115CYGR115C 780 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YJL120WYJL120W 324 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-1.09□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 CWC23YGL128C 852 nt-1.1□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 RPS30AYLR287C-A 192 nt-1.1□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 YML108WYML108W 318 nt-1.1□□□□□ -2.58
GDB1Q06625 ECL1YGR146C 636 nt-1.1□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 POL32YJR043C 1053 nt-1.11□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 IPP1YBR011C 864 nt-1.11□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 YLR171WYLR171W 390 nt-1.12□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 MRPS8YMR158W 468 nt-1.13□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 DCP1YOL149W 696 nt-1.13□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 RRI2YOL117W 1938 nt-1.13□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-1.14□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.15□□□□□ -2.59
GDB1Q06625 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-1.16□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 YNL319WYNL319W 441 nt-1.18□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 IRC16YPR038W 360 nt-1.18□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 YOR015WYOR015W 360 nt-1.19□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 SPC24YMR117C 642 nt-1.2□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 YKL202WYKL202W 582 nt-1.2□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-1.2□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 LOC1YFR001W 615 nt-1.21□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 RPS20YHL015W 366 nt-1.22□□□□□ -2.6
GDB1Q06625 YGL239CYGL239C 315 nt-1.23□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 VAM3YOR106W 852 nt-1.24□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 GRX5YPL059W 453 nt-1.24□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.25□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 ILM1YJR118C 612 nt-1.25□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-1.25□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YDR220CYDR220C 294 nt-1.26□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-1.26□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 snR72snR72 98 nt-1.27□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-1.27□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YBR099CYBR099C 384 nt-1.27□□□□□ -2.61
GDB1Q06625 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.29□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.29□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 ATG16YMR159C 453 nt-1.29□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 BUD26YDR241W 288 nt-1.3□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 SRB7YDR308C 423 nt-1.3□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 YGR228WYGR228W 345 nt-1.3□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.3□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 ATG31YDR022C 591 nt-1.31□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 RPF1YHR088W 888 nt-1.31□□□□□ -2.62
GDB1Q06625 YOL029CYOL029C 606 nt-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 448.7 ms