Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms