Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GBE1Q04446 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GBE1Q04446 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms