Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APBA1Q02410 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APBA1Q02410 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms