Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPCQ01831 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPCQ01831 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPCQ01831 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPCQ01831 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPCQ01831 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms