Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms