Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDLBPQ00341 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms