Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXO4P98177 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXO4P98177 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms