Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FAM3AP98173 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FAM3AP98173 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FAM3AP98173 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM3AP98173 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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