Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUCB2P80303 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms