Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBB4BP68371 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms