Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCS1P62166 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NCS1P62166 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NCS1P62166 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NCS1P62166 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCS1P62166 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCS1P62166 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms