Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-21P61565 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms