Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms