Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2FP61218 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2FP61218 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms