Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXL3P58215 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms