Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB25P57735 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB25P57735 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms