Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms