Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATN1P54259 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATN1P54259 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATN1P54259 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms