Protein–RNA interactions for Protein: P53330

RTT102, Regulator of Ty1 transposition protein 102, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT102P53330 CSN9YDR179C 489 nt1.11□□□□□ -2.23
RTT102P53330 YGR035CYGR035C 351 nt1.11□□□□□ -2.23
RTT102P53330 PCC1YKR095W-A 267 nt1.11□□□□□ -2.23
RTT102P53330 STO1YMR125W 2586 nt1.11□□□□□ -2.23
RTT102P53330 MAM33YIL070C 801 nt1.1□□□□□ -2.23
RTT102P53330 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.1□□□□□ -2.23
RTT102P53330 PKH2YOL100W 3246 nt1.1□□□□□ -2.23
RTT102P53330 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.09□□□□□ -2.23
RTT102P53330 NIP100YPL174C 2607 nt1.09□□□□□ -2.24
RTT102P53330 PDE2YOR360C 1581 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YDL206WYDL206W 2289 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 GPG1YGL121C 381 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 IFH1YLR223C 3258 nt1.08□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YIR044CYIR044C 186 nt1.07□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YPR012WYPR012W 255 nt1.07□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.07□□□□□ -2.24
RTT102P53330 APL1YJR005W 2103 nt1.06□□□□□ -2.24
RTT102P53330 BUD3YCL014W 4911 nt1.06□□□□□ -2.24
RTT102P53330 CUL3YGR003W 2235 nt1.06□□□□□ -2.24
RTT102P53330 BIL1YOR304C-A 231 nt1.06□□□□□ -2.24
RTT102P53330 NST1YNL091W 3723 nt1.05□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YJR011CYJR011C 786 nt1.05□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YOR029WYOR029W 336 nt1.05□□□□□ -2.24
RTT102P53330 YLR334CYLR334C 381 nt1.04□□□□□ -2.24
RTT102P53330 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.24
RTT102P53330 RPL35AYDL191W 363 nt1.03□□□□□ -2.24
RTT102P53330 PAN2YGL094C 3348 nt1.03□□□□□ -2.24
RTT102P53330 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 NUP157YER105C 4176 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 RPL34BYIL052C 366 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YLL007CYLL007C 1998 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 WAR1YML076C 2835 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 RPS30BYOR182C 192 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YAR029WYAR029W 225 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT102P53330 HTB2YBL002W 396 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT102P53330 PTP2YOR208W 2253 nt1□□□□□ -2.25
RTT102P53330 PAM16YJL104W 450 nt1□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YDR521WYDR521W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
RTT102P53330 OST1YJL002C 1431 nt0.98□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YCK3YER123W 1575 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YHL042WYHL042W 453 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT102P53330 YBR206WYBR206W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT102P53330 GEA2YEL022W 4380 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT102P53330 INA22YIR024C 651 nt0.96□□□□□ -2.26
RTT102P53330 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
RTT102P53330 DOP1YDR141C 5097 nt0.95□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YPR117WYPR117W 7470 nt0.95□□□□□ -2.26
RTT102P53330 KAP120YPL125W 3099 nt0.94□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.94□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YBR064WYBR064W 429 nt0.94□□□□□ -2.26
RTT102P53330 HMRA2YCR096C 360 nt0.93□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YDR048CYDR048C 315 nt0.93□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YPR197CYPR197C 564 nt0.93□□□□□ -2.26
RTT102P53330 UBP3YER151C 2739 nt0.93□□□□□ -2.26
RTT102P53330 SMC1YFL008W 3678 nt0.93□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YDL196WYDL196W 330 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT102P53330 TAR1YLR154W-C 375 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT102P53330 YAF9YNL107W 681 nt0.91□□□□□ -2.26
RTT102P53330 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 SCC2YDR180W 4482 nt0.9□□□□□ -2.27
RTT102P53330 HMRA1YCR097W 381 nt0.89□□□□□ -2.27
RTT102P53330 SSS1YDR086C 243 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 ISD11YER048W-A 285 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 OLI1Q0130 231 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 ECM12YHR021W-A 456 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YJL120WYJL120W 324 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 RPS25BYLR333C 327 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YDR102CYDR102C 333 nt0.87□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YDR344CYDR344C 444 nt0.87□□□□□ -2.27
RTT102P53330 GIM4YEL003W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.87□□□□□ -2.27
RTT102P53330 MCM10YIL150C 1716 nt0.86□□□□□ -2.27
RTT102P53330 DBP6YNR038W 1890 nt0.86□□□□□ -2.27
RTT102P53330 SPO21YOL091W 1830 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT102P53330 snR56snR56 88 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT102P53330 IES4YOR189W 351 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT102P53330 ALG13YGL047W 609 nt0.84□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.84□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YOR282WYOR282W 321 nt0.84□□□□□ -2.27
RTT102P53330 YPL044CYPL044C 549 nt0.84□□□□□ -2.27
RTT102P53330 BFR2YDR299W 1605 nt0.83□□□□□ -2.28
RTT102P53330 NHP2YDL208W 471 nt0.83□□□□□ -2.28
RTT102P53330 CMC4YMR194C-B 222 nt0.83□□□□□ -2.28
RTT102P53330 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
RTT102P53330 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.82□□□□□ -2.28
RTT102P53330 YPL225WYPL225W 441 nt0.82□□□□□ -2.28
RTT102P53330 NOP9YJL010C 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
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