Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 APL3YBL037W 3078 nt0.9□□□□□ -2.26
SYF2P53277 HMRA1YCR097W 381 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YOR029WYOR029W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YBR012CYBR012C 420 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 LCD1YDR499W 2244 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 RAD34YDR314C 2079 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SPT21YMR179W 2277 nt0.9□□□□□ -2.27
SYF2P53277 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SWI4YER111C 3282 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF2P53277 MPT5YGL178W 2580 nt0.89□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
SYF2P53277 RPL35AYDL191W 363 nt0.88□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YJR011CYJR011C 786 nt0.88□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SET3YKR029C 2256 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 ALY2YJL084C 3141 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SLI15YBR156C 2097 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 GIM4YEL003W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 MAM33YIL070C 801 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 BIL1YOR304C-A 231 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 RIM20YOR275C 1986 nt0.87□□□□□ -2.27
SYF2P53277 STB6YKL072W 2301 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 snR56snR56 88 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 STO1YMR125W 2586 nt0.86□□□□□ -2.27
SYF2P53277 SMC1YFL008W 3678 nt0.85□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.85□□□□□ -2.27
SYF2P53277 FIG4YNL325C 2640 nt0.85□□□□□ -2.27
SYF2P53277 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF2P53277 PCC1YKR095W-A 267 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF2P53277 HTB2YBL002W 396 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF2P53277 PAU24YBR301W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
SYF2P53277 IFH1YLR223C 3258 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YPR197CYPR197C 564 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF2P53277 PKH2YOL100W 3246 nt0.83□□□□□ -2.28
SYF2P53277 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 PAM16YJL104W 450 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YAR029WYAR029W 225 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YAF9YNL107W 681 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YPL225WYPL225W 441 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YBR206WYBR206W 324 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YDL206WYDL206W 2289 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 MMS4YBR098W 2076 nt0.82□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YDR102CYDR102C 333 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YDR521WYDR521W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YCK3YER123W 1575 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF2P53277 PDE2YOR360C 1581 nt0.81□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YDR048CYDR048C 315 nt0.8□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.8□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YAR009CYAR009C 3591 nt0.8□□□□□ -2.28
SYF2P53277 CUL3YGR003W 2235 nt0.79□□□□□ -2.28
SYF2P53277 GPG1YGL121C 381 nt0.79□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.79□□□□□ -2.28
SYF2P53277 OST1YJL002C 1431 nt0.79□□□□□ -2.28
SYF2P53277 PAN2YGL094C 3348 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YLL007CYLL007C 1998 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 SSS1YDR086C 243 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YIR044CYIR044C 186 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 TAR1YLR154W-C 375 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 YBR064WYBR064W 429 nt0.78□□□□□ -2.28
SYF2P53277 NUP157YER105C 4176 nt0.78□□□□□ -2.29
SYF2P53277 KAP120YPL125W 3099 nt0.78□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.76□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YHL042WYHL042W 453 nt0.76□□□□□ -2.29
SYF2P53277 WAR1YML076C 2835 nt0.75□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.75□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YJL120WYJL120W 324 nt0.75□□□□□ -2.29
SYF2P53277 GEA2YEL022W 4380 nt0.75□□□□□ -2.29
SYF2P53277 PTP2YOR208W 2253 nt0.75□□□□□ -2.29
SYF2P53277 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
SYF2P53277 INA22YIR024C 651 nt0.74□□□□□ -2.29
SYF2P53277 UTP20YBL004W 7482 nt0.73□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YDR344CYDR344C 444 nt0.73□□□□□ -2.29
SYF2P53277 RPS25BYLR333C 327 nt0.73□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.73□□□□□ -2.29
SYF2P53277 SPO21YOL091W 1830 nt0.73□□□□□ -2.29
SYF2P53277 DBP6YNR038W 1890 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 HMRA2YCR096C 360 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 ATP6Q0085 780 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 RPS30BYOR182C 192 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 MCM10YIL150C 1716 nt0.72□□□□□ -2.29
SYF2P53277 YDL196WYDL196W 330 nt0.71□□□□□ -2.3
SYF2P53277 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
SYF2P53277 ECM12YHR021W-A 456 nt0.71□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.71□□□□□ -2.3
SYF2P53277 snR36snR36 182 nt0.71□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YFL032WYFL032W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YDL073WYDL073W 2955 nt0.7□□□□□ -2.3
SYF2P53277 HTL1YCR020W-B 237 nt0.69□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YFL063WYFL063W 456 nt0.69□□□□□ -2.3
SYF2P53277 OLI1Q0130 231 nt0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms