Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms