Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK8P49336 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK8P49336 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK8P49336 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK8P49336 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms