Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC11A1P49279 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms