Protein–RNA interactions for Protein: P49207

RPL34, 60S ribosomal protein L34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL34P49207 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL34P49207 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL34P49207 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms