Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMTP48728 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMTP48728 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMTP48728 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMTP48728 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms