Protein–RNA interactions for Protein: P48525

MSE1, Glutamate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSE1P48525 NOP14YDL148C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
MSE1P48525 STH1YIL126W 4080 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 STF2YGR008C 255 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 RCO1YMR075W 2055 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 MAD1YGL086W 2250 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 SBE22YHR103W 2559 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 GIP3YPL137C 3831 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 ZRG8YER033C 3231 nt2.17□□□□□ -2.06
MSE1P48525 MET18YIL128W 3099 nt2.16□□□□□ -2.06
MSE1P48525 IRA2YOL081W 9240 nt2.16□□□□□ -2.06
MSE1P48525 PRP5YBR237W 2550 nt2.16□□□□□ -2.06
MSE1P48525 HSH155YMR288W 2916 nt2.16□□□□□ -2.06
MSE1P48525 YNL144CYNL144C 2223 nt2.16□□□□□ -2.06
MSE1P48525 CHS6YJL099W 2241 nt2.15□□□□□ -2.06
MSE1P48525 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YFR016CYFR016C 3702 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 ENV11YGR071C 2583 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SAP185YJL098W 3177 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 DBP10YDL031W 2988 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YLL054CYLL054C 2532 nt2.15□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SGS1YMR190C 4344 nt2.14□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YPR097WYPR097W 3222 nt2.14□□□□□ -2.07
MSE1P48525 TIM9YEL020W-A 264 nt2.14□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.14□□□□□ -2.07
MSE1P48525 NAB6YML117W 3405 nt2.14□□□□□ -2.07
MSE1P48525 IFH1YLR223C 3258 nt2.13□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.13□□□□□ -2.07
MSE1P48525 DGR2YKL121W 2559 nt2.13□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SAS3YBL052C 2496 nt2.12□□□□□ -2.07
MSE1P48525 BNI1YNL271C 5862 nt2.12□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SAC3YDR159W 3906 nt2.11□□□□□ -2.07
MSE1P48525 VTC3YPL019C 2508 nt2.11□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.11□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.11□□□□□ -2.07
MSE1P48525 PHO91YNR013C 2685 nt2.11□□□□□ -2.07
MSE1P48525 ZIP1YDR285W 2628 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 snR70snR70 164 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 TFC3YAL001C 3483 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SCD5YOR329C 2619 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 PTP2YOR208W 2253 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 MSB1YOR188W 3414 nt2.1□□□□□ -2.07
MSE1P48525 SIR4YDR227W 4077 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 APL2YKL135C 2181 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 snR81snR81 201 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YDR521WYDR521W 336 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.09□□□□□ -2.07
MSE1P48525 UBP2YOR124C 3819 nt2.09□□□□□ -2.08
MSE1P48525 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 BUB1YGR188C 3066 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 TRL1YJL087C 2484 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 YGL182CYGL182C 324 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 QCR9YGR183C 201 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 DGR1YNL130C-A 147 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 STB6YKL072W 2301 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 FKS3YMR306W 5358 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 INO80YGL150C 4470 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 TTI1YKL033W 3117 nt2.08□□□□□ -2.08
MSE1P48525 ALK1YGL021W 2283 nt2.07□□□□□ -2.08
MSE1P48525 SEC63YOR254C 1992 nt2.07□□□□□ -2.08
MSE1P48525 SMC6YLR383W 3345 nt2.07□□□□□ -2.08
MSE1P48525 MMS22YLR320W 4365 nt2.07□□□□□ -2.08
MSE1P48525 CHC1YGL206C 4962 nt2.07□□□□□ -2.08
MSE1P48525 SAP190YKR028W 3102 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 SSD1YDR293C 3753 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 snR39BsnR39B 96 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 HSL1YKL101W 4557 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 MDS3YGL197W 4464 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 YPP1YGR198W 2454 nt2.06□□□□□ -2.08
MSE1P48525 VPS8YAL002W 3825 nt2.05□□□□□ -2.08
MSE1P48525 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.05□□□□□ -2.08
MSE1P48525 LHS1YKL073W 2646 nt2.04□□□□□ -2.08
MSE1P48525 RTT107YHR154W 3213 nt2.04□□□□□ -2.08
MSE1P48525 DCP2YNL118C 2913 nt2.04□□□□□ -2.08
MSE1P48525 SCP160YJL080C 3669 nt2.04□□□□□ -2.08
MSE1P48525 PDR11YIL013C 4236 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 CDC60YPL160W 3273 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 NEO1YIL048W 3456 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 USO1YDL058W 5373 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.02□□□□□ -2.09
MSE1P48525 UBP1YDL122W 2430 nt2.01□□□□□ -2.09
MSE1P48525 UFD4YKL010C 4452 nt2.01□□□□□ -2.09
MSE1P48525 RPL37BYDR500C 267 nt2.01□□□□□ -2.09
MSE1P48525 TUS1YLR425W 3924 nt2.01□□□□□ -2.09
MSE1P48525 SYH1YPL105C 2550 nt2.01□□□□□ -2.09
MSE1P48525 AGC1YPR021C 2709 nt2□□□□□ -2.09
MSE1P48525 snR62snR62 100 nt2□□□□□ -2.09
MSE1P48525 RTT101YJL047C 2529 nt2□□□□□ -2.09
MSE1P48525 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.99□□□□□ -2.09
MSE1P48525 APL1YJR005W 2103 nt1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms