Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A3P43003 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms