Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPOP42166 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPOP42166 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPOP42166 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPOP42166 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms