Protein–RNA interactions for Protein: P38864

YHR173C, Uncharacterized protein YHR173C, yeastyeast

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR173CP38864 YGR228WYGR228W 345 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR173CP38864 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR173CP38864 YOR248WYOR248W 303 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR173CP38864 SOV1YMR066W 2697 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR173CP38864 BUL2YML111W 2763 nt-0.28□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 SNU56YDR240C 1479 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 COY1YKL179C 2040 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 ILM1YJR118C 612 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YNL211CYNL211C 261 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YOL160WYOL160W 342 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YBR206WYBR206W 324 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 EFR3YMR212C 2349 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YAP6YDR259C 1152 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YKL136WYKL136W 399 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 ECM9YKR004C 1134 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 RAD34YDR314C 2079 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 NNF2YGR089W 2811 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 snR8snR8 190 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 BUD26YDR241W 288 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YER135CYER135C 393 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 AFB1YLR040C 675 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YMR254CYMR254C 309 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YPR039WYPR039W 336 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YPL185WYPL185W 396 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 PAA1YDR071C 576 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YGL239CYGL239C 315 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YML108WYML108W 318 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 DCP1YOL149W 696 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YKU70YMR284W 1809 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 HAL9YOL089C 3093 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 MRPL32YCR003W 552 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 YLR171WYLR171W 390 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 snR128snR128 126 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 NIP1YMR309C 2439 nt-0.35□□□□□ -2.46
YHR173CP38864 SPO21YOL091W 1830 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 PBI2YNL015W 228 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YOL029CYOL029C 606 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 PRP39YML046W 1890 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.36□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 snR9snR9 187 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 SBH2YER019C-A 267 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YJR011CYJR011C 786 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 HUR1YGL168W 333 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YGR115CYGR115C 780 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YGR164WYGR164W 336 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 SCEIQ0160 708 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YPL261CYPL261C 309 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 snR51snR51 107 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 POP7YBR167C 423 nt-0.39□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YEL073CYEL073C 324 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YIR044CYIR044C 186 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR173CP38864 YCR001WYCR001W 315 nt-0.41□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YKL202WYKL202W 582 nt-0.41□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 IPP1YBR011C 864 nt-0.41□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 APQ13YJL075C 417 nt-0.42□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YLR101CYLR101C 396 nt-0.42□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 RAD61YDR014W 1944 nt-0.42□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 SDH7YDR511W 402 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 MND1YGL183C 660 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 UBS1YBR165W 834 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YGR025WYGR025W 303 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YJL007CYJL007C 315 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 SGF11YPL047W 300 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 PTP2YOR208W 2253 nt-0.45□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.45□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 CSE1YGL238W 2883 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 UTP8YGR128C 2142 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 TIM13YGR181W 318 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YJR087WYJR087W 351 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 YPT6YLR262C 648 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 HTB2YBL002W 396 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR173CP38864 ECL1YGR146C 636 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 RPS20YHL015W 366 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YHL041WYHL041W 450 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YPR092WYPR092W 306 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 SEC10YLR166C 2616 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 ATG31YDR022C 591 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YGL230CYGL230C 444 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YNL319WYNL319W 441 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YPL182CYPL182C 384 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 BER1YLR412W 825 nt-0.5□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.51□□□□□ -2.49
YHR173CP38864 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91.9 ms