Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGP37231 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPARGP37231 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGP37231 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms