Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL4P36578 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL4P36578 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms