Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BMI1P35226 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BMI1P35226 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BMI1P35226 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms