Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFNP31947 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFNP31947 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFNP31947 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFNP31947 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFNP31947 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFNP31947 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFNP31947 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFNP31947 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFNP31947 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFNP31947 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms