Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOBEC3AP31941 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3AP31941 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms