Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD11P31277 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD11P31277 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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