Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXC13P31276 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXC13P31276 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms