Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms