Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB5P28074 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms